Κορονοϊός: «Πνίγει» την Αττική η μετάλλαξη Όμικρον – Έφτασε στο 87% στα λύματα
Δραματική εξάπλωση της μετάλλαξης Όμικρον στην Αττική «δείχνει» η νέα μέθοδος εντοπισμού μεταλλαγμένων και παραλλαγμένων στελεχών του κορονοϊού στα λύματα που αναπτύχθηκε από το ΕΚΠΑ. «Κατατροπώνεται» η «Δέλτα».
Τα δεδομένα για την εξάπλωση της μετάλλαξης Όμικρον στην Αττική συλλέχθηκαν από τα λύματα, σε καθημερινή βάση, από τις 27 Δεκεμβρίου έως την 1η Ιανουαρίου.
Τα αποτελέσματα της ανάλυσης ανέδειξαν την επικράτηση, σε ποσοστό 87% με
Η νέα μέθοδος ανιχνεύει έγκαιρα, ακόμη και από 50ml λύματος ή οποιουδήποτε περιβαλλοντικού δείγματος, νέες μεταλλάξεις και στελέχη/παραλλαγές που μόλις άρχισαν να εισέρχονται στον πληθυσμό. Επίσης, διαπιστώθηκε, για πρώτη φορά, η παρουσία δύο στελεχών της παραλλαγής Omicron, τα οποία φέρουν επιπλέον μεταλλάξεις. Εντοπίστηκαν δηλαδή δυο νέες μεταλλάξεις Όμικρον.
Με τον τρόπο αυτό γίνεται με μεγαλύτερη ευκολία και αξιοπιστία η γονιδιωματική επιτήρηση των νέων στελεχών/παραλλαγών του SARS-CoV-2 (κορονοϊός), καθώς και άλλων ιών ή βακτηρίων, δίνοντας την αναγκαία πληροφόρηση για την επιδημιολογική επιτήρηση καθώς και τον ανασχεδιασμό των νέων εμβολίων και φαρμακευτικών πρωτοκόλλων.
Από την ανάλυση των δεδομένων με τη νέα μέθοδο, φαίνεται επίσης ότι εκτός της μεταβλητότητας υπάρχουν και αρκετοί συνδυασμοί των διαφορετικών μεταλλάξεων του ιού, που πιθανόν να επικρατούν κάθε φορά με διαφορετική κλινική συμπεριφορά, γεγονός που απαιτεί επαγρύπνηση και πιστή εφαρμογή των μέτρων προστασίας, σημειώνουν οι επιστήμονες του ΕΚΠΑ.
Το σχετικό άρθρο δημοσιεύτηκε στο έγκριτο διεθνές επιστημονικό περιοδικό «International Journal of Molecular Sciences», ενώ έχει κατατεθεί από το ΕΚΠΑ αίτηση για χορήγηση Εθνικού και Διεθνών Διπλωμάτων Ευρεσιτεχνίας.
Η νέα μέθοδς του ΕΚΠΑΣτο Εθνικό και Καποδιστριακό Πανεπιστήμιο Αθηνών (ΕΚΠΑ), μέσω της συνεργασίας Ερευνητικών Μονάδων των Τμημάτων Βιολογίας, Ιατρικής και Χημείας, στο πλαίσιο έρευνας με επιστημονικό υπεύθυνο τον Καθηγητή Ανδρέα Σκορίλα και διεπιστημονική ομάδα του ΕΚΠΑ που αποτελείται από τους Νικόλαο Θωμαΐδη, Μαργαρίτη Αυγέρη, Αθηνά Μάρκου, Εύη Λιανίδου, Δημήτριο Γουργιώτη, Θεοδώρα Ψαλτοπούλου, Παναγιώτη Αδαμόπουλο, Μάριο Διαμαντόπουλο, Λάμπρο Δημητρακόπουλο, Κατερίνα Γαλάνη, Μάριο Κωστάκη, Κατερίνα Κοντού, Βασίλη Καπέ, Νικόλαο Βούλγαρη και Θάνο Δημόπουλο (Πρύτανης ΕΚΠΑ) , έχει αναπτυχθεί νέα μοριακή μεθοδολογία ευαίσθητης ανίχνευσης και ποσοτικού προσδιορισμού των μεταλλαγμένων στελεχών/παραλλαγών του SARS-CoV-2 σε δείγματα λυμάτων με χρήση μιας σειράς μοριακών μεθόδων και αλληλούχηση επόμενης γενιάς (Next Generation Sequencing/NGS).
Η συγκεκριμένη υπερευαίσθητη μεθοδολογία είναι ιδιαίτερα σημαντική διότι δείχνει την παρουσία και την εκατοστιαία αναλογία των μεταλλαγμένων στελεχών στο σύνολο του πληθυσμού μιας πόλης. Επιπλέον, ανιχνεύει έγκαιρα, ακόμη και από 50ml λύματος ή οποιουδήποτε περιβαλλοντικού δείγματος, νέες μεταλλάξεις και στελέχη/παραλλαγές που μόλις άρχισαν να εισέρχονται στον πληθυσμό.
Με τον τρόπο αυτό γίνεται με μεγαλύτερη ευκολία και αξιοπιστία η γονιδιωματική επιτήρηση των νέων στελεχών/παραλλαγών του SARS-CoV-2, καθώς και άλλων ιών ή βακτηρίων, δίνοντας την αναγκαία πληροφόρηση για την επιδημιολογική επιτήρηση καθώς και τον ανασχεδιασμό των νέων εμβολίων και φαρμακευτικών πρωτοκόλλων. Το σχετικό άρθρο δημοσιεύτηκε στο έγκριτο διεθνές επιστημονικό περιοδικό «International Journal of Molecular Sciences», ενώ έχει κατατεθεί από το ΕΚΠΑ αίτηση για χορήγηση Εθνικού και Διεθνών Διπλωμάτων Ευρεσιτεχνίας.
Η μεθοδολογία πληροί τις προϋποθέσεις τής από 15-3-2021 σχετικής σύστασης της Ευρωπαϊκής Επιτροπής για την κοινή προσέγγιση κατά τη δημιουργία συστηματικής επιτήρησης του SARS-CoV-2 και των παραλλαγών του στα λύματα. Επιπροσθέτως, ανιχνεύει εγκαίρως νέα στελέχη/παραλλαγές που αρχίζουν να εισέρχονται στην κοινότητα.
Με την εφαρμογή της νέας μεθοδολογίας έχει ολοκληρωθεί η ανάλυση μεταλλαγμένων στελεχών του SARS-CoV-2 σε δείγματα λυμάτων της Περιφερειακής Ενότητας Αττικής, που συλλέχθηκαν σε καθημερινή βάση κατά το διάστημα 27-12/2021 έως 1-1-2022 από το Κέντρο Επεξεργασίας Λυμάτων της Ψυττάλειας (ΚΕΛΨ).
Τα συγκεκριμένα δείγματα υπεβλήθησαν σε έλεγχο ειδικών μεταλλάξεων – γενετικών δεικτών (genetic markers) ολόκληρου του γονιδίου S (Spike) (>100 γενετικοί δείκτες) για τις παραλλαγές ειδικού ενδιαφέροντος (Variants οf Concern – VOC) και τις παραλλαγές υπό διερεύνηση (Variants οf Interest – VOI).
Τα αποτελέσματα της ανάλυσης ανέδειξαν την επικράτηση, σε ποσοστό 87% με σημαντική πολυμορφία, της παραλλαγής Omicron (B.1.1.529 lineage) και την ταυτόχρονη σημαντική μείωση των αντίστοιχων γενετικών δεικτών του στελέχους Delta (B.1.617.2 lineage).
Πιο συγκεκριμένα, διαπιστώθηκε η παρουσία ειδικών μεταλλάξεων (genetic markers) του γονιδίου S (Spike) της παραλλαγής Omicron (B.1.1.529 lineage):
– στο τμήμα “receptor-binding domain/RBD” σε ποσοστό 87% (γενετικοί δείκτες: G339D, S371L, S373P, S375F, K417N, N440K, G446S)
– στο τμήμα “receptor-binding motif/RBM” σε ποσοστό 29% (γενετικοί δείκτες: S477N, E484A, Q493R, G496S, Q498R, N501Y, Y505H)
– εκτός των RBD/RBM τμημάτων σε ποσοστό 45% (γενετικοί δείκτες: T547K, H655Y, N679K, P681H, N764K, D796Y, N856K, Q954H, N969K, L981F)
Ταυτόχρονα διαπιστώθηκε, για πρώτη φορά, η παρουσία δύο στελεχών της παραλλαγής Omicron, τα οποία φέρουν (συγχαρτογραφούνται) επιπλέον μεταλλάξεις, και συγκεκριμένα:
– η μετάλλαξη R346K (B.1.1.529+R346K), σε ποσοστό 27%, η οποία έχει αναφερθεί στην παραλλαγή Mu (B1.621)
– η μετάλλαξη A701V (B.1.1.529+A701V), σε ποσοστό 5%, η οποία έχει αναφερθεί στην παραλλαγή Beta (B1.351)
Με βάση τα ανώτερα αποτελέσματα διαπιστώνεται η επικράτηση της παραλλαγής Όμικρον στην Αττική (σε ποσοστό 87% από
- Δημοφιλέστερες Ειδήσεις Κατηγορίας Ειδήσεις
- ΕΚΤΑΚΤΟ: Τηλεοπτικό διάγγελμα Μητσοτάκη σήμερα – Για την ακρίβεια
- «Βόμβα» Πέτσα: Έρχονται νέα υποχρεωτικά εμβόλια – Αλλιώς πρόστιμο 100 ευρώ/μήνα
- Τα παπούτσια που επιστρέφουν από το 2000 και είναι η τελευταία τάση της μόδας
- Χάνουν το σπίτι για ένα σκύλο: Μια πολύ σκληρή υπόθεση στη Θεσσαλονίκη
- ΕΝΗΜΕΡΩΣΗ ΕΚΤΑΚΤΑ ΜΕΤΡΑ ΠΡΟΣΤΑΣΙΑΣ Δ.Υ ΚΑΙ ΟΔΗΓΙΕΣ ΕΟΔΥ-ΥΠΟΔΕΙΓΜΑ ΒΕΒΑΙΩΣΗΣ
- Survivor 5: Χάος στο αγώνισμα - Βαριές κουβέντες και νταϊλίκια
- Εύβοια: Τον έλουσε με οινόπνευμα και πήγε να τον κάψει ζωντανό
- Δημήτρης Χριστοδούλου: Ο σπουδαιότερος εν ζωή Έλληνας μαθηματικός
- Στο εδώλιο για υπεξαίρεση ο εργάτης που αγόρασε... δοχείο που έκρυβε 50.000 ευρώ
- Έσκασε το μπαμ με Κουτίνιο
- Δημοφιλέστερες Ειδήσεις Newsvoice
- Τελευταία Νέα Newsvoice
- Κορονοϊός: «Πνίγει» την Αττική η μετάλλαξη Όμικρον – Έφτασε στο 87% στα λύματα
- Τα περιστατικά άνοιας στην Ελλάδα θα αυξηθούν κατά 45% έως το 2050
- Το νέο Opel Insignia θα μετατραπεί σε SUV!
- «Μήλο» από χρυσάφι – Η Apple έγινε η πρώτη εταιρεία με αξία πάνω από 3 τρισ. δολάρια
- Κορονοϊός: Η υπνική παράλυση πιθανή παρενέργεια σε ασθενείς με τη μετάλλαξη Όμικρον
- Με κορονοϊό ο Σταμάτης Μαλέλης
- Κορονοϊός – Κύπρος: Δύο υποχρεωτικά PCR για τους ταξιδιώτες, ένα πριν την αναχώρηση και ένα κατά την άφιξη
- Πέδρο Μαρτίνς μετά το Απόλλων – Ολυμπιακός: «Δεν υπάρχουν δικαιολογίες, να μας γίνει μάθημα»
- Ινστιτούτο Γερμανικής Οικονομίας: «Μόνο Ελλάδα και Πορτογαλία έχουν ρεαλιστική προοπτική μείωσης του χρέους τους»
- Ο Κυριάκος Μητσοτάκης συνεχάρη τον νέο πρωθυπουργό της Ρουμανίας – Αποδέχτηκε πρόσκληση να επισκεφθεί το Βουκουρέστι
- Τελευταία Νέα Κατηγορίας Ειδήσεις
- Ξεκίνησε το νέο σύστημα καταχώρισης ληξιαρχικών πράξεων Ελλήνων του εξωτερικού
- Πέτσας για σχολεία: Αν μειωθεί το 50%+1, θα κλείσουν τα σχολεία
- Γιαμαρέλλου – Ενδεχομένως και πάνω από 50.000 κρούσματα
- Αλέξανδρος Διαμαντής: O 26χρονος σκηνοθέτης του Ντον Ζουάν μιλά στο NEWS 24/7
- Κίνα: Πάνω από 20 άνθρωποι παγιδεύτηκαν έπειτα από έκρηξη σε καντίνα
- Υποχρεωτικός εμβολιασμός: Ραντεβού ως 16 Ιανουαρίου για τους ανεμβολίαστους άνω των 60 αλλιώς πρόστιμο – Ποιοι εξαιρούνται
- Ανεπηρέαστες από την κρίση του Καζακστάν οι συζητήσεις ΗΠΑ-Ρωσίας για την Ουκρανία
- Μειωμένα ενοίκια: Έως τη Δευτέρα οι δηλώσεις από τους εκμισθωτές ακινήτων
- Κινδυνεύουν να χάσουν το σπίτι τους επειδή… γάβγισε ο σκύλος τους
- «Πόλεμος» στο Twitter για Τζόκοβιτς – «Τον έκαναν ήρωα – Δεν πήγε απρόσκλητος»