Το ΑΠΘ εντόπισε την μετάλλαξη Όμικρον στα λύματα της Θεσσαλονίκης πριν καν ανιχνευθεί κρούσμα
Η παρουσία της άκρως μεταδοτικής μετάλλαξης Όμικρον του SARS-CoV-2 στην κοινότητα της Θεσσαλονίκης επιβεβαιώθηκε από αναλύσεις της Ομάδας Επιδημιολογίας Λυμάτων του ΑΠΘ στα αστικά απόβλητα της πόλης.
Η ανίχνευση έγινε σε δείγμα της Κυριακής 19 Δεκεμβρίου 2021, μέσα από νέα πρωτοποριακή -υψηλής ευαισθησίας και ακρίβειας και σε πραγματικό
«Δε μας εκπλήσσει η παρουσία του στελέχους Όμικρον στη Θεσσαλονίκη, είναι μία αναμενόμενη εξέλιξη, όπως αναμενόμενη είναι και η επικράτησή του το επόμενο διάστημα. Αλλά είναι ιδιαίτερα σημαντικό ότι σήμερα, πριν ακόμη εντοπιστεί η μετάλλαξη σε εργαστηριακά επιβεβαιωμένο κρούσμα στην πόλη, ερχόμαστε να προσφέρουμε στην Πολιτεία ένα ακόμη πολύτιμο εργαλείο έγκαιρης και αξιόπιστης πρόβλεψης για την επιδημιολογική κατάσταση και πορεία της πανδημίας», δήλωσε στο ΑΠΕ-ΜΠΕ ο πρύτανης του ΑΠΘ και επιστημονικά υπεύθυνος του ερευνητικού έργου, καθηγητής Νίκος Παπαϊωάννου.
«Παγκόσμια πρωτοπορία- στη διάθεση του ΕΟΔΥ για μετρήσεις και σε άλλες πόλεις»Η μέθοδος ανίχνευσης και ποσοτικοποίησης του στελέχους Όμικρον με χρήση real-time PCR συνιστά παγκόσμια πρωτοπορία, καθώς δεν υπάρχει σήμερα κάτι αντίστοιχο στη διεθνή βιβλιογραφία και γι’ αυτό, όπως γνωστοποίησε ο κ. Παπαϊωάννου, «η ομάδα του ΑΠΘ προχωράει άμεσα σε υποβολή σχετικής προδημοσίευσης σε διεθνές καταθετήριο επιστημονικών εργασιών (medRxiv) και επιπλέον θέτει τη μέθοδο στη διάθεση του Δικτύου Επιδημιολογίας Λυμάτων του ΕΟΔΥ, ώστε να εφαρμοστεί άμεσα και σε άλλες πόλεις στην Ελλάδα».
Η ανίχνευση και ποσοτικοποίηση του στελέχους Όμικρον στα λύματα, όταν ταυτόχρονα υπάρχουν υψηλές συγκεντρώσεις του Δέλτα, δεν είναι εφικτή με τις υπάρχουσες εργαστηριακές μοριακές δοκιμές PCR. «Σήμερα σε όλον τον κόσμο οι μόνες αξιόπιστες προσπάθειες προσδιορισμού του στελέχους Όμικρον αφορούν χρονοβόρες μεθόδους παράλληλης αλληλούχισης εκατομμυρίων νουκλεοτιδίων του ιού μετά από επίπονες διαδικασίες προσυγκέντρωσης των δειγμάτων. Ανταποκρινόμενη στην απαίτηση για έγκαιρη ανίχνευση και ποσοτικοποίηση του στελέχους Όμικρον στα λύματα, η Ομάδα Επιδημιολογίας Λυμάτων του ΑΠΘ κατάφερε μέσα σε μικρό χρονικό διάστημα να αναπτύξει μία νέα μοριακή μέθοδο real-time PCR, που έχει τη δυνατότητα να πολλαπλασιάζει επιλεκτικά το τμήμα του γονιδιώματος που κωδικοποιεί την πρωτεΐνη ακίδα του στελέχους Όμικρον και όχι του Δέλτα», εξήγησε ο πρύτανης του ΑΠΘ.
Η νέα μέθοδος βασίζεται σε τεχνογνωσία που πρόσφατα δημοσίευσαν σε διεθνή επιστημονικά περιοδικά υψηλού κύρους μέλη της Ομάδας Επιδημιολογίας Λυμάτων του ΑΠΘ από το Διαγνωστικό Εργαστήριο του Τμήματος Κτηνιατρικής ΑΠΘ και αφορά την ανίχνευση και τυποποίηση του ιού LSDV που προσβάλλει τα βοοειδή, καθώς και των στελεχών Άλφα, Βήτα, Γάμα και Δέλτα του SARS-CoV-2 σε κλινικά δείγματα.
Η μέθοδος χρησιμοποιεί τροποποιημένο LNA ιχνηλάτη και εντοπίζει συνολικά δύο βασικές γενετικές υπογραφές, συγκεκριμένα την περιοχή νουκλεοτιδικών απαλείψεων στις θέσεις S69-70 και τη μετάλλαξη S:T95I, ικανές να χαρακτηρίσουν την παραλλαγή Όμικρον και να τη διαφοροποιήσουν από τα άλλα στελέχη ειδικού ενδιαφέροντος που κυκλοφορούν στην κοινότητα. Γίνεται έτσι εφικτή η ειδική, ευαίσθητη ανίχνευση και ακριβής ποσοτικοποίηση του ιικού φορτίου του στελέχους Όμικρον στα λύματα, ανεξαρτήτως της ποσότητας του φορτίου του Δέλτα, το οποίο κυριαρχεί ακόμα στην κοινότητα.
Ο άμεσος σχεδιασμός της δοκιμής στα τέλη Νοεμβρίου, όταν πλέον υπήρχε ικανή πληροφορία από τις γενετικές παραλλαγές του στελέχους Όμικρον, επέτρεψε στην Ομάδα Επιδημιολογίας Λυμάτων του ΑΠΘ να προβεί στην έγκαιρη προμήθεια αντιδραστηρίων με αποτέλεσμα από τις 16 Δεκεμβρίου και μετά να ελέγχονται σε πραγματικό χρόνο και χωρίς καθυστερήσεις τα λύματα της Θεσσαλονίκης για την παρουσία του στελέχους Όμικρον.
To άρθρο Το ΑΠΘ εντόπισε την μετάλλαξη Όμικρον στα λύματα της Θεσσαλονίκης πριν καν ανιχνευθεί κρούσμα δημοσιεύτηκε στο NewsIT .
- Δημοφιλέστερες Ειδήσεις Κατηγορίας Ειδήσεις
- «Γενικό lockdown από 3 Ιανουαρίου και για ένα μήνα» - Πόσο κοστίζει η καθυστέρηση
- Χαμός στον ΑΝΤ1 – Μπορεί ο Σεφερλής να «αποτελειώσει» τον Κανάκη;
- Τουρκία: Η άνοδος της λίρας έβγαλε στους δρόμους τους οπαδούς του Ερντογάν
- Καταιγιστικές εξελίξεις: Ψάχνουν για να συλλάβουν τον Στάθη Παναγιωτόπουλο
- Μυθική γκάφα: Ανακοίνωσαν τον νικητή του MasterChef πριν προβληθεί ο τελικός (vid)
- Παππάς: Με την απλή αναλογική η ΝΔ θα χάσει τουλάχιστον 40 έδρες
- Μαριάννα Τουμασάτου: «Ο Πέτρος Φιλιππίδης θεωρώ ότι το έκανε επίτηδες»
- Mπράβο: Ο Μπακογιάννης ακύρωσε λόγω πανδημίας το χριστουγεννιάτικο ρεβεγιόν στην πλατεία Κοτζιά
- "Dune", Μπιγιόνσε, Μπίλι Άιλις πάνε για Όσκαρ- Ποιοι μένουν εκτός
- Στάθης Παναγιωτόπουλος: Τον αναζητά η αστυνομία στο πλαίσιο του αυτοφώρου
- Δημοφιλέστερες Ειδήσεις NewsIt
- Δημοσθένης Σαρηγιάννης: Πρόταση για γενικό lockdown – Η έκθεση που στέλνει στον Κυριάκο Μητσοτάκη
- Το ΑΠΘ εντόπισε την μετάλλαξη Όμικρον στα λύματα της Θεσσαλονίκης πριν καν ανιχνευθεί κρούσμα
- Σουηδοί εμφυτεύουν μικροτσίπ με το πιστοποιητικό εμβολιασμού τους
- Άρση ασυλίας του Νίκου Παππά για το «perouka gate» αποφάσισε η Βουλή
- Άγριες Μέλισσες: ανάστατο το Διαφάνι και ο τρόμος για την αποκάλυψη
- Κοντά στη Φενέρμπαχτσε ο Γιόακιμ Λεβ
- Audi: Ένα βήμα πριν την είσοδό της στη Formula 1
- Ψάχνουν παντού τον Στάθη Παναγιωτόπουλο για να τον συλλάβουν - Πως κινήθηκαν οι διαδικασίες
- Κινέζα έχει τη μεγαλύτερη συλλογή με χιονόμπαλες – Ξόδεψε 165.000 δολάρια
- «Μήνυμα» Μπορέλ στην Τουρκία: Υπογράψτε τη Σύμβαση για το Δίκαιο της Θάλασσας
- Τελευταία Νέα NewsIt
- Το ΑΠΘ εντόπισε την μετάλλαξη Όμικρον στα λύματα της Θεσσαλονίκης πριν καν ανιχνευθεί κρούσμα
- Άρση ασυλίας του Νίκου Παππά για το «perouka gate» αποφάσισε η Βουλή
- Κινέζα έχει τη μεγαλύτερη συλλογή με χιονόμπαλες – Ξόδεψε 165.000 δολάρια
- Άγριες Μέλισσες: ανάστατο το Διαφάνι και ο τρόμος για την αποκάλυψη
- Ελεγκτικό Συνέδριο: «Πράσινο φως» για το καζίνο στο Ελληνικό
- Καλαμάτα: Βρέφος γεννήθηκε και πέθανε μέσα σε τροχόσπιτο
- Κύπρος: Βίντεο από την έναρξη της γεώτρησης στο Οικόπεδο 10
- Κοντά στη Φενέρμπαχτσε ο Γιόακιμ Λεβ
- Μαδαγασκάρη: Βρέθηκαν άλλα 25 πτώματα από το ναυάγιο στο Σεντ Μαρί – 64 συνολικά οι νεκροί
- «Βουλιάζουν» οι χειμερινοί προορισμοί - Πληρότητα ακόμα και 100% στα ξενοδοχεία
- Τελευταία Νέα Κατηγορίας Ειδήσεις
- Ιταλία: Ο Μάριο Ντράγκι «φλερτάρει» με την προεδρία – Άφησε να εννοηθεί πως είναι έτοιμος να την αναλάβει
- Σχολεία - Χανιά: Δεκάδες τα κρούσματα σε μαθητές - Ανησυχία για τη διασπορά του κορονοϊού
- Τουρκία: «Πράσινο φως» στο TurkoVac για έκτακτη χρήση
- Ιταλοί γιατροί τραγουδούν «ναι στο εμβόλιο» με χριστουγεννιάτικο ρυθμό
- Βουλή: Άρση ασυλίας του Ν. Παππά για την υπόθεση Δημάδη
- Θοδωρής Μαραντίνης: «Πήγαμε να διαλύσουμε πολλές φορές τους Onirama, υπήρξαν εντάσεις»
- Λιβύη: Οριστική αναβολή των εκλογών - Σε νέο αδιέξοδο η χώρα
- Υπουργείο Εργασίας: Διάκριση για το τηλεφωνικό κέντρο 1555 εξυπηρέτησης πολιτών
- “Χριστούγεννα Μουσικά στη Χανιώτικη Αγορά” – Μαλαξιανάκης, Λαμπρόπουλος και FreakTones σήμερα σε κεντρικούς δρόμους της πόλης
- Παπαμιμίκος: Να φύγουμε απ’ την ανακύκλωση των ίδιων προσώπων - Τι απαντά στον Γιώργο Παπανδρέου, τι λέει για τη Θεσσαλονίκη